В качестве водяного знака (вотермарка) программа позволяет использовать текстовую надпись, изображение, анимированный файл GIF, видеоклип, векторные фигуры, такие как прямоугольник и эллипс. К вотермаркам можно применять разные эффекты, такие как размножение, отбрасывание тени, добавление объема, кривизна. При необходимости можно использовать пошаговый мастер.

С Watermark Master можно наложить субтитры на видео. В качестве источника можно использовать DVD субтитры или SRT файлы.

Кроме того, программа Watermark Master будет полезна для пользователей, которым необходимо удалить статичный объект (например, логотип канала или артефакты кодека) из видео или графического файла. Для этой цели были разработаны две функции:

- размывание объекта — в данном случае объект просто размыт в соответствии с заданными параметрами
- удаление объекта — в данном случае объект удаляется, а удаленные пиксели компенсируются пикселями, прилегающими к удаленному объекту.